Introducción: Las infecciones respiratorias agudas constituyen un grupo complejo de enfermedades que varían desde un resfriado hasta procesos broncopulmonares graves. Entre los agentes causales figuran los virus quienes se diseminan por las secreciones respiratorias. Objetivos: Caracterizar la circulación de virus respiratorios en pacientes con IRA. Método: Estudio observacional descriptivo realizado en el Centro Provincial de Higiene, Epidemiologia y Microbiología (CPHEM) de Camagüey durante el período enero 2011 hasta junio 2013. Se estudiaron 691 pacientes ingresados en unidades hospitalarias con los diagnósticos de IRA grave, enfermedad tipo influenza (ETI) y brotes. Se les colectó muestras de exudados nasofaríngeos y en caso de fallecidos, tejido pulmonar, ambas tipo de muestra fueron colectadas en medio de transporte virológico  acompañados de una encuesta. Se remitieron al CPHEM y de allí al Instituto de Medicina Tropical  Pedro Kourí  de La Habana donde se les realizó diagnóstico por Biología Molecular (PCR en tiempo real). Resultados: Del total de 691 pacientes el 40.3% fueron positivos a  virus respiratorios.  Hubo 420 IRA grave, 134 ETI y 31 brotes,  con positividad entre  43 y 58%. En el período enero 2011 a junio 2013 la positividad se incrementó  hasta 65,6% en las ETI. El virus pandémico influenza A H1N1pdm09 se elevó hasta 98% en las ETI. Rinovirus ocupó el segundo lugar en todos los tipos de IRA. En los pacientes con IRA grave se diagnosticaron más de 8 familias virales y 5 tipos de coinfecciones a expensas de Rinovirus. Conclusiones: En las IRA grave, ETI y brotes, se incrementó  la circulación del virus influenza A H1N1pdm09.